Utworzony uchwałą Prezydium Rządu z dn.04.06.1955 jako Zakład II Instytutu Badań Jądrowych. W maju 1959 zmiana nazwy na: Ośrodek Fizyki Jądrowej w Krakowie. W lipcu 1960 przekształcony w Instytut Fizyki Jądrowej. W 1988 przyjęcie imienia patronackiego. Od 2003 jest instytutem Polskiej Akademii Nauk.

WoL'1990. - 40 ed. - London, 1989 (Instytut Fizyki Jądrowej)

WoL'1991. - 41 ed. - London, 1990 (Instytut Fizyki Jądrowej im. Henryka Niewodniczańskiego)

Nauka Polska. - R.3 nr 2 (1955); R.9 nr 4 (1961); R.14 nr 3 (1966).

Postępy Techniki Jądrowej. - R.37 z.2 (1994); R.38 z.3 (1995).

NATO Advanced Research Workshop on the Structure of Mesons, Baryons and Nuclei, Cracow, Poland, May 26-30, 1998 : [proceedings / org. by Institute of Nuclear Physics Cracow, Forschungszentrum Jülich, Jagellonian University Cracow] // Acta Phys. Pol., B. - Vol.29, no.9 (1998)

XLIV Cracow School of Theoretical Physics, Zakaopane, Poland, may 28-June 6, 2004. - Cracow, 2004.

Atomic nuclei at extreme values of temperature, spin and isospin : XXXIX Zakopane School of Physics [... / ed. of the proceedings: Adam Maj, Maria Kmiecik]. - Cracow, 2005. Org. (Instytut Fizyki Jądrowej PAN et al.)

Report on Research Activities 2005/2006 / The Henryk Niewodniczański Institute of Nuclear Physics. Polish Academy of Sciences ; ed. by B. Brzezicka. - Kraków, 2007.

Dozymetria indywidualna promieniowania jonizującego z zastosowaniem termoluminescencyjnego czytnika z kamerą CCD / Renata Kopeć. - Kraków, 2009. Inst. spr.

Cracow Epiphany Conference on Hadron Interactions at the Dawn of the LHC, Cracow, Poland, January 5-7, 2009 // Acta Phys. Pol., B. - Vol. 40, no. 7 (2009) Org. (Institute of Nuclear Physics Polish Academy of Science [et al.])

Numeryczne metody analizy widm promieniowania gamma i ich zastosowanie w badaniach skał / Jan Swakoń. - Kraków, 1993. Inst. spr.

Cracow Epiphany Conference on Present and Future of B Physics / Maciej Skrzypek and Mariusz Witek, eds. of the proceedings. - Cracow, 2012. Org. (H. Niewodniczański Institute of Nuclear Physics PAN)

Gluons from logarithmic slopes of F2 in the NLL approximation / K. Golec-Biernat. - Kraków, 1994.

Quarks with a pion condensate -a new phase of matter / Wojciech Broniowski, Andrzej Kotlosz, Marek Kutschera. - Kraków, 1990. Wydaw. (IFJ)

Symfonia C++ standard. T. 1 / Jerzy Grębosz. - Wyd. 3 rozsz. i popr. - Kraków, 2008. S. tyt.: (Instytut Fizyki Jądrowej im. H. Niewodniczańskiego. Polska Akademia Nauk Kraków).

Wielofunkcyjne materiały polimerowe w oparciu o poliuretanosacharydy modyfikowane funkcjonalizowaną ceramiką bioaktywną do regeneracji tkanki kostnej / Monika Szlachta ; Akademia Górniczo-Hutnicza im. Stanisława Staszica w Krakowie. Wydział Inżynierii Materiałowej i Ceramiki. Katedra Biomateriałów i Kompozytów ; Instytut Fizyki Jądrowej Polskiej Akademii Nauk im. Henryka Niewodniczańskiego w Krakowie. - Kraków, 2022.